買収金額をどのように決めたら良いですか？

売却側は高く買ってほしいと思い、一方で買収側は安く買いたいという思いが拮抗しています。

金額だけを突き詰めていくと値段の叩き合いになるので、本質的には買収側の企業がどのような条件で買収したいか？の基準となる条件の指標を事前に決めておくことがポイントになります。
例えば、投資額に対してどのくらいの期間で回収したいのか？どのような目的の投資なのか？などです。
また、交渉時に譲渡希望会社へ買収に関する指標を説明し、ご理解いただくこともM&A成功の秘訣となります。